تحتوي بذور الكتان على زيت ثابت بنسبة تصل إلى 40 ٪ تقريباً، وهو زيت له قيمة غذائية كبيرة، وحوالي 90 ٪ من الأحماض الدهنية من أهمها حمض اللينولينيك، وحمض اللينليتيك ( أوميغا 6 الاحماض الدهنية غير المشبعة) وفي كل مئة غرام من هذا الزيت، 55 غرام من زيت اوميغا 3.  كما يحتوي على بروتينات وصموغ وجلوكوزيدات اللينامارين الذي يكوّن السيانوجين وجلوكوزيد السيانوفوريك.  ويستخرج من البذور ذات الرائحة المميزة زيت يطلق عليه اسم الزيت الحار والمعروف بالسيرج، وعدا عن استخدامه طبياً فإنه يباع كزيت للطبخ في كل المحلات التجارية، ويستبدل بزيت الزيتون وزيت دوار الشمس.  وأثبتت دراسات كثيرة حديثة أن مشروب مسحوق بذور الكتان ملين ومدر للبول، ويفيد كثيرا في علاج النزلات الصدرية.  ونظراً لأنه غني بالدهون والمواد الهلامية فإنه يشكل علاجاً جيداً لكثير من المشاكل المعوية والصدرية، لا سيما عندما تؤخذ البذور كاملة داخلياً فإنها تخفف التهيج في القناة الهضمية، وتمتص السوائل لانها تشكل كتلة هلامية تعمل كملين كتلي فعال.  وتستعمل هذه البذور لمعالجة الامساك وقرحة المعدة والاثني عشر والحصوات والتهابات الجهاز البولي.  إذ تغلى كمية ملعقة كبيرة من البذور المجروشة في كوب ماء كبير وتترك لمدة 10 دقائق ثم تحرك جيدا وتشرب كاملة بما في ذلك الحبوب المجروشة وذلك بمعدل مرتين في الصباح وفي المساء.  ولعلاج القروح وتيفوئيد الأمعاء والحصوات المرارية ونوبات المغص يستعمل زيت بذور الكتان بمعدل ملعقة صغيرة 3 مرات يوميا.