جددت وزارة الخارجية السودانية على أن ما يجري في مصر حالياً شأن داخلي يخص شعبها ومؤسساتها القومية وقواها السياسية. وذكرت وسائل إعلامية سودانية إن وزير الخارجية السوداني علي أحمد كرتي أجرى اتصالاً هاتفياً بنظيره المصري محمد كامل عمرو على خلفية نشر صحيفة أخبار اليوم  المصرية  تصريحاً منسوباً لوكيل جهاز المخابرات العامة المصرية السابق اللواء ثروت جودة مفاده أنه تحصل على نسخة رسالة من الرئيس السوداني عمر البشير إلى نظيره المصري المعزول محمد مرسي، بعد قرار عزله. وقال الناطق الرسمي باسم وزارة الخارجية السودانية السفيرابو بكر الصديق  إن كرتي أبلغ نظيره المصري إن الخبر محاولة للإساءة للعلاقات بين البلدين، وكاشفا أن  الخارجية استدعت القائم بالأعمال المصري في الخرطوم ونفت ما جاء  في الخبر وأكدت أنه غير صحيح، وهو محاولة للإيقاع بين البلدين الشقيقين. وأصدرت الخارجية تعميماً صحفياً ردا على ما نشر، قائلة فيه "نشرت بوابة أخبار اليوم  المصرية بتاريخ   /7/2013  تصريحاً منسوباً لوكيل جهاز المخابرات العامة المصرية السابق اللواء ثروت جودة مفاده أنه تحصل على نسخة رسالة مزعومة من الرئيس السوداني عمر البشير إلى الرئيس المصري المعزول محمد مرسي ، بعد قرار عزله ، ونشر الموقع الإلكتروني ما يفترض أنه نص الرسالة المزعومة والتي تضمنت خطوات يٌدعي أن السودان سيقوم بها في مواجهة التطورات الأخيرة في مصر ، بما يتضمن تدخلاً سافراً في الشؤون الداخلية لمصر وإحداث فتنة داخلها". وأوضحت الخارجية السودانية أن ما نشر محض افتراء يعبر عن محاولة ساذجة ومغرضة للنيل من العلاقات بين البلدين الشقيقين.